Последовательное сравнение нескольких строк: различия между версиями

Перейти к навигации Перейти к поиску
Строка 67: Строка 67:


== Применение ==
== Применение ==
Алгоритмы решения задачи сравнения нескольких строк (MSM) служат базой для многомерного сравнения с шаблоном и приближенного сравнения с шаблоном с использованием подстановочных знаков. Эта задача часто встречается в таких областях, как вычислительная биология, поиск в базах данных, библиографический поиск, выявление вирусов в потоках данных и многие другие.
== Экспериментальные результаты ==
Книга Наварро и Раффино [8] будет полезна для введения в данную область. В ней представлены графики экспериментов, отражающие экспериментальную оценку работы алгоритмов сравнения нескольких строк для различных значений размера алфавита, длины шаблона и размера множества шаблонов.
== Ссылка на код ==
Эффективное решение задачи MSM обеспечивают такие хорошо известные пакеты, как agrep (http://webglimpse.net/download.html, поддиректория верхнего уровня agrep/) и grep с опцией F (http://www.gnu.org/software/grep/grep.html).
== См. также ==
* [[Индексированное сравнение строк]] относится к случаю, при котором возможна предварительная обработка текста
* [[Многомерное сравнение строк]] относится к случаю, при котором текст имеет больше одного измерения
* [[Сравнение регулярных выражений]] – более сложный случай, где шаблон может быть регулярным выражением
* [[Последовательное точное сравнение строк]] – версия, в которой в тексте ищется один шаблон
== Литература ==
Дополнительную информацию можно найти в следующих книгах: [5, 6, 8] и [9].
1. Aho, A.V., Corasick, M.J.: Efficient string matching: an aid to bibliographic search. C. ACM 18(6), 333-340 (1975)
2. Allauzen, C., Crochemore, M., Raffinot, M.: Factor oracle: a new structure for pattern matching. In: SOFSEM'99. LNCS, vol. 1725, pp. 291-306. Springer, Berlin (1999)
3. Commentz-Walter, B.: A string matching algorithm fast on the average. In: Proceedings of ICALP'79. LNCS, vol. 71, pp. 118-132. Springer, Berlin (1979)
4. Crochemore,  M.,  Czumaj,  A.,  Gasieniec,  L.,  Lecroq,  T., Plandowski,  W.,  Rytter,  W.:  Fast  practical  multi-pattern matching. Inf. Process. Lett. 71(3-4), 107-113 (1999)
5. Crochemore, M., Hancart, C., Lecroq, T.: Algorithms on strings. Cambridge University Press, Cambridge (2007)
6. Gusfield, D.: Algorithms on strings, trees and sequences. Cambridge University Press, Cambridge (1997)
7. Navarro, G., Raffinot, M.: Fast and flexible string matching by combining bit-parallelism and suffix automata. ACM J. Exp. Algorithm 5,4 (2000)
8. Navarro, G., Raffinot, M.: Flexible Pattern Matching in Strings - Practical on-line search algorithms for texts and biological sequences. Cambridge University Press, Cambridge (2002)
9. Smyth, W.F.: Computing Patterns in Strings. Addison Wesley Longman (2002)
10. Wu, S., Manber, U.: Agrep - a fast approximate pattern-matching tool. In: Proceedings of USENIX Winter (1992) Technical Conference, pp. 153-162. USENIX Association, Berkeley (1992)
11. Wu, S., Manber, U.: A fast algorithm for multi-pattern searching. Report TR-94-17, Department of Computer Science, University of Arizona, Tucson, AZ (1994)
Источник — http://pco.iis.nsk.su/wega/index.php/Последовательное_сравнение_нескольких_строк