Аноним

Параметризованные алгоритмы графического представления графов: различия между версиями

Материал из WEGA
 
(не показано 12 промежуточных версий 1 участника)
Строка 43: Строка 43:


== Основные результаты ==
== Основные результаты ==
Для задач, для которых не предполагается существования полиномиальных алгоритмов, очень желательно найти точные алгоритмы с экспоненциальным временем исполнения.
Для задач, для которых не предполагается существования полиномиальных алгоритмов, очень желательно найти точные алгоритмы с экспоненциальным временем выполнения.




Строка 62: Строка 62:




'''Теорема 4 ([9]). Если k – минимальное количество пересечений ребер в экземпляре задачи OSCM <math>(G = (V_1, V2_, E), <_1 )\;</math>, то <math>\sum_{u, v \in V_2, u \ne v} min \{ c_{uv}, v_{vu} \} \le k < 1,4664 \sum_{u, v \in V_2, u \ne v} min \{ c_{uv}, v_{vu} \} \;</math>'''.
'''Теорема 4 ([9]). Если k – минимальное количество пересечений ребер в экземпляре задачи OSCM <math>(G = (V_1, V_2, E), <_1 )\;</math>, то <math>\sum_{u, v \in V_2, u \ne v} min \{ c_{uv}, v_{vu} \} \le k < 1,4664 \sum_{u, v \in V_2, u \ne v} min \{ c_{uv}, v_{vu} \} \;</math>'''.




Нагамочи предложил алгоритм аппроксимации с коэффициентом меньше 1,4664.
Нагамочи предложил аппроксимационный алгоритм с коэффициентом меньше 1,4664.


Далее, для любого <math>u \in V_2 \;</math> с <math>deg(u) > 0 \;</math> обозначим за <math>l_u \;</math> самого левого соседа u в <math>L_1 \;</math>, а за <math>r_u \;</math> – самого правого. Две вершины <math>u, v \in V_2 \;</math> называются неподходящими, если существует некоторое <math>x \in N(u) \;</math>, такое, что <math>l_v <_1 x <_1 r_v \;</math>, либо существует некоторое <math>x \in N(v) \;</math>, такое, что <math>l_u <_1 x <_1 r_u \;</math>. В противном случае они называются подходящими. Заметим, что для подходящих <math>{u, v} c_{uv} \cdot c_{vu} = 0 \;</math>. Джумович и Уайтсайдз показали:
Далее, для любой вершины <math>u \in V_2 \;</math> с <math>deg(u) > 0 \;</math> обозначим за <math>l_u \;</math> самого левого соседа u в <math>L_1 \;</math>, а за <math>r_u \;</math> – самого правого. Две вершины <math>u, v \in V_2 \;</math> называются неподходящими, если существует некоторое <math>x \in N(u) \;</math>, такое, что <math>l_v <_1 x <_1 r_v \;</math>, либо существует некоторое <math>x \in N(v) \;</math>, такое, что <math>l_u <_1 x <_1 r_u \;</math>. В противном случае они называются подходящими. Заметим, что для подходящих <math>\{ u, v \} \;</math> верно <math>c_{uv} \cdot c_{vu} = 0 \;</math>. Джумович и Уайтсайдз показали:




'''Лемма 5 ([5])'''. При любом оптимальном отношении порядка <math><_2 \;</math> на вершинах <math>V_2 \;</math>, <math>u <_2 v \;</math> найдено, если <math>r_u \le_1 l_v \;</math>.
'''Лемма 5 ([5])'''. При любом оптимальном отношении порядка <math><_2 \;</math> на вершинах <math>V_2 \;</math>, <math>u <_2 v \;</math> найдено, если <math>r_u \le_1 l_v \;</math>.


Это означает, что все подходящие пары встречаются в своем естественном порядке.
Это означает, что все подходящие пары встречаются в своем ''естественном порядке''.




Строка 91: Строка 91:




Этот простой алгоритм поиска по дереву можно улучшить. Во-первых, отметим, что нет необходимости ветвления в {x, y} С V2, если cxy = cyx. Это позволяет внести две модификации в Алгоритм 1:
Этот простой алгоритм поиска по дереву можно улучшить. Во-первых, отметим, что нет необходимости ветвления в <math>\{ x, y \} \subset V_2 \;</math>, если <math>c_{xy} = c_{yx} \;</math>. Это позволяет внести две модификации в Алгоритм 1:


• На строке 5 следует исключить <math>c_{xy} = c_{yx} \;</math>.
• На строке 5 следует исключить равенство <math>c_{xy} = c_{yx} \;</math>.


• На строке 12 следует произвольным образом включить некоторую пару <math>\{ x, y \} \subset V_2 \;</math>, которая еще не была включена, и рекурсивно повторять это действие; только если включены все пары <math>\{ x, y \} \subset V_2 \;</math>, следует вернуть значение ДА.
• На строке 12 следует произвольным образом включить некоторую пару <math>\{ x, y \} \subset V_2 \;</math>, которая еще не была включена, и рекурсивно повторять это действие; только если включены все пары <math>\{ x, y \} \subset V_2 \;</math>, следует вернуть значение ДА.
Строка 100: Строка 100:
В результате модификаций получен алгоритм решения задачи OSCM с параметром <math>O^*(1,6182^k) \;</math>. Он составляет ядро алгоритма Джумовича и Уайтсайдза [5]. В их работе более детально обсуждаются следующие вопросы:
В результате модификаций получен алгоритм решения задачи OSCM с параметром <math>O^*(1,6182^k) \;</math>. Он составляет ядро алгоритма Джумовича и Уайтсайдза [5]. В их работе более детально обсуждаются следующие вопросы:


• Как эффективно вычислить все количества пересечений cxy на этапе предварительной обработки?
• Как эффективно вычислить все количества пересечений <math>c_{xy} \;</math> на этапе предварительной обработки?


• Как интегрировать в алгоритм элементы ветвления и обрезки, полезные с практической точки зрения?
• Как интегрировать в алгоритм элементы ветвления и обрезки, полезные с практической точки зрения?
Строка 110: Строка 110:




'''Теорема 7. Задачу односторонней минимизации пересечений можно решить за время <math>O^*(l,4656^k) \;</math>.'''
'''Теорема 7. Задачу односторонней минимизации пересечений можно решить за время <math>O^*(1,4656^k) \;</math>.'''




Возможный вариант исполнения улучшенного алгоритма поиска по дереву приведен на рис. 2, а его (оптимальный) результат – на рис. 3.
Возможный вариант выполнения улучшенного алгоритма поиска по дереву приведен на рис. 2, а его (оптимальный) результат – на рис. 3.




Строка 134: Строка 134:
'''Варианты этой задачи и родственные ей проблемы''' широко рассматривались в литературе.
'''Варианты этой задачи и родственные ей проблемы''' широко рассматривались в литературе.


1. Изменение цели оптимизации: минимизация количества дуг, участвующих в пересечениях – одноуровневая планаризация. Как было отмечено в [7, 10], из теоремы 2 практически непосредственно следует идея алгоритма решения этой задачи с временем исполнения <math>O^*(3^k) \;</math>, которое впоследствии было улучшено в [10] до <math>O^*(2^k) \;</math>.
1. Изменение цели оптимизации: минимизация количества дуг, участвующих в пересечениях – одноуровневая планаризация. Как было отмечено в [7, 10], из теоремы 2 практически непосредственно следует идея алгоритма решения этой задачи с временем выполнения <math>O^*(3^k) \;</math>, которое впоследствии было улучшено в [10] до <math>O^*(2^k) \;</math>.


2. Можно повысить число степеней свободы, рассматривая два или более уровня присваиваний в одно и то же время. Параметризованные алгоритмы для минимизации пересечений и для планаризации были предложены в [3, 7, 10].
2. Можно повысить число степеней свободы, рассматривая два или более уровня присваиваний в одно и то же время. Параметризованные алгоритмы для минимизации пересечений и для планаризации были предложены в [3, 7, 10].
Строка 141: Строка 141:


== Применение ==
== Применение ==
Помимо рассмотрения вопроса графического построения двудольных графов как задачи, интересной самой по себе (т.е., например, для качественного изображения диаграмм отношений), этот вопрос естественным образом возникает при применении так называемого подхода Судзиямы к построению иерархических графов [12]. Этот исключительно популярный подход решает задачу укладки иерархического графа в три этапа: (1) удаление циклов, (2) присваивание вершин уровням, (3) присваивание вершин уровням. Последний этап обычно реализуется посредством алгоритма с заметающей прямой, в процессе работы решающего несколько экземпляров задачи односторонней минимизации пересечений. Третий вариант задачи, упомянутый выше, находит множество важных вариантов применения в вычислительной биологии.  
Помимо рассмотрения вопроса графического построения двудольных графов как задачи, интересной самой по себе (например, для качественного изображения диаграмм отношений), этот вопрос естественным образом возникает при применении так называемого подхода Судзиямы к построению иерархических графов [12]. Этот исключительно популярный подход решает задачу укладки иерархического графа в три этапа: (1) удаление циклов, (2) присваивание вершин уровням, (3) присваивание вершин уровням. Последний этап обычно реализуется посредством алгоритма с заметающей прямой, в процессе работы решающего несколько экземпляров задачи односторонней минимизации пересечений. Третий вариант задачи, упомянутый выше, находит множество важных вариантов применения в вычислительной биологии.
 


== Открытые вопросы ==
== Открытые вопросы ==
Как и для всех алгоритмов с экспоненциальным временем исполнения, оказывается непросто улучшить это время или доказать определенную нижнюю границу времени исполнения при наличии разумных теоретико-сложностных предположений. Заметим, что негласные предположения, лежащие в основе подхода параметризованных алгоритмов, в данном сценарии полностью удовлетворяются: к примеру, графическое представление с большим количеством пересечений будет неприемлемым (если такая ситуация встретится на практике, придется прибегнуть к другому способу представления информации); таким образом, можно обоснованно предполагать, что параметр действительно окажется малым.
Как и для всех алгоритмов с экспоненциальным временем выполнения, оказывается непросто улучшить это время или доказать определенную нижнюю границу времени выполнения при наличии разумных теоретико-сложностных предположений. Заметим, что негласные предположения, лежащие в основе подхода параметризованных алгоритмов, в данном сценарии полностью удовлетворяются: к примеру, графическое представление с большим количеством пересечений будет неприемлемым (если такая ситуация встретится на практике, придется прибегнуть к другому способу представления информации); таким образом, можно обоснованно предполагать, что параметр действительно окажется малым.




Строка 184: Строка 183:


12. Sugiyama, K., Tagawa, S., Toda, M.: Methods for visual understanding of hierarchical system structures. IEEE Trans. Syst. Man Cybernet. 11 (2), 109-125 (1981)
12. Sugiyama, K., Tagawa, S., Toda, M.: Methods for visual understanding of hierarchical system structures. IEEE Trans. Syst. Man Cybernet. 11 (2), 109-125 (1981)
[[Категория: Совместное определение связанных терминов]]