4501
правка
Irina (обсуждение | вклад) |
Irina (обсуждение | вклад) |
||
Строка 3: | Строка 3: | ||
== Постановка задачи == | == Постановка задачи == | ||
Одним из наиболее многообещающих способов определения эволюционного расстояния между двумя организмами является сравнение порядка появления идентичных (например, ортологичных) генов в их геномах. Соответствующая задача перестройки генома заключается в нахождении кратчайшей последовательности операций перегруппировки, при помощи которых один геном можно перестроить в другой. В работе [8] Хартман и Шаран предложили алгоритм 1,5-аппроксимации для решения задачи сортировки при помощи транспозиций, транспозиций-обращений и двойных обращений, улучшив ранее полученный коэффициент аппроксимации для этой задачи. Их алгоритм также работает быстрее современных аналогов, требуя <math>O(n^{3/2} \sqrt{log \; n})</math> времени для n генов. | Одним из наиболее многообещающих способов определения эволюционного расстояния между двумя организмами является сравнение порядка появления идентичных (например, ортологичных) генов в их геномах. Соответствующая задача перестройки генома заключается в нахождении кратчайшей последовательности операций перегруппировки, при помощи которых один геном можно перестроить в другой. В работе [8] Хартман и Шаран предложили алгоритм 1,5-аппроксимации для решения задачи сортировки при помощи транспозиций, транспозиций-обращений и двойных обращений, улучшив ранее полученный коэффициент аппроксимации 1,75 для этой задачи. Их алгоритм также работает быстрее современных аналогов, требуя <math>O(n^{3/2} \sqrt{log \; n})</math> времени для n генов. | ||
== Нотация и определение == | == Нотация и определение == |
правка