4511
правок
Irina (обсуждение | вклад) |
Irina (обсуждение | вклад) м (→Применение) |
||
Строка 18: | Строка 18: | ||
== Применение == | == Применение == | ||
Некоторые организмы имеют одну хромосому либо содержат однохромосомные органеллы (такие как митохондрии или хлоропласты), эволюция которых в значительной степени зависит от эволюции ядерного генома. Если имеется конкретная нить одиночной хромосомы, линейная или кольцевая, мы можем вывести упорядочение и направленность генов, представив таким образом каждую хромосому в виде упорядочения ориентированных генов. Во многих случаях | Некоторые организмы имеют одну хромосому либо содержат однохромосомные органеллы (такие как митохондрии или хлоропласты), эволюция которых в значительной степени зависит от эволюции ядерного генома. Если имеется конкретная нить одиночной хромосомы, линейная или кольцевая, мы можем вывести упорядочение и направленность генов, представив таким образом каждую хромосому в виде упорядочения ориентированных генов. Во многих случаях эволюционный процесс, действующий над подобными однохромосомными организмами, состоит главным образом из инверсий фрагментов хромосомы; это открытие позволило многим биологам реконструировать филогении на основе порядка генов, используя в качестве меры эволюционного расстояния между двумя геномами расстояние инверсии, т.е. наименьшее количество инверсий, необходимое для преобразования одной подписанной перестановки в другую [11, 12, 14]. | ||
Данный линейный алгоритм получил широкое распространении (в течение первых нескольких лет после публикации на него было сделано почти 200 ссылок). Среди примеров использования можно упомянуть обработку многохромосомных перестановок генома [16], сравнение геномов [5], разбор вторичной структуры РНК [13] и филогенетическое исследование вируса ВИЧ-1 [2]. | Данный линейный алгоритм получил широкое распространении (в течение первых нескольких лет после публикации на него было сделано почти 200 ссылок). Среди примеров использования можно упомянуть обработку многохромосомных перестановок генома [16], сравнение геномов [5], разбор вторичной структуры РНК [13] и филогенетическое исследование вируса ВИЧ-1 [2]. | ||
== Открытые вопросы == | == Открытые вопросы == | ||
Необходима разработка эффективных алгоритмов для вычисления минимальных расстояний для инверсий с весами, транспозиций и инвертированных транспозиций. | Необходима разработка эффективных алгоритмов для вычисления минимальных расстояний для инверсий с весами, транспозиций и инвертированных транспозиций. |
правок