Преобразование Барроуза-Уилера: различия между версиями

Перейти к навигации Перейти к поиску
м
Строка 191: Строка 191:
'''Теорема 6. Пусть s[1, n] – строка над алфавитом <math>\Sigma \;</math> константного размера. Строка <math>\hat{s} = bwt(s) \;</math> может быть вычислена за время O(n) с использованием O(n log n) бит рабочего пространства.'''
'''Теорема 6. Пусть s[1, n] – строка над алфавитом <math>\Sigma \;</math> константного размера. Строка <math>\hat{s} = bwt(s) \;</math> может быть вычислена за время O(n) с использованием O(n log n) бит рабочего пространства.'''


Доказательство. Суффиксный массив строки s можно вычислить за время O(n) с использованием O(nlog n) ) бит рабочего пространства при помощи, например, алгоритма из [ ]. Суффиксный массив представляет собой строку целых чисел sa[1, n], такую, что для i = 1, ... , n значением s[sa[i], n - 1] является i-й суффикс s в лексикографическом порядке. Поскольку префиксом каждой строки матрицы <math>\mathcal{M} \;</math> является уникальный суффикс s, за которым идет специальный символ $, суффиксный массив обеспечивает упорядочение строк в <math>\mathcal{M} \;</math>. Следовательно, bwt(s) можно вычислить из sa за линейное время при помощи процедуры sa2bwt на рис. 2. □
Доказательство. Суффиксный массив строки s можно вычислить за время O(n) с использованием O(nlog n) бит рабочего пространства при помощи, например, алгоритма из [11]. Суффиксный массив представляет собой массив целых чисел sa[1, n], такой, что для i = 1, ... , n значением s[sa[i], n - 1] является i-й суффикс s в лексикографическом порядке. Поскольку префиксом каждой строки матрицы <math>\mathcal{M} \;</math> является уникальный суффикс s, за которым идет специальный символ $, суффиксный массив обеспечивает упорядочение строк в <math>\mathcal{M} \;</math>. Следовательно, bwt(s) можно вычислить из sa за линейное время при помощи процедуры sa2bwt на рис. 2. □




4551

правка

Навигация