Аноним

Преобразование Барроуза-Уилера: различия между версиями

Материал из WEGA
Строка 132: Строка 132:




На рис. 1 имеет место <math>\Psi(2) = 7 \;</math>, и <math>F[2] \;</math> и <math>\hat{s}[7] \;</math> занимают вторую позицию в соответствующих строках. Это свойство обычно формулируется так: соответствующие символы имеют один и тот же относительный порядок в строках F и <math>\hat{s}</math>.
На рис. 1 имеет место <math>\Psi(2) = 7 \;</math>, и <math>F[2] \;</math> и <math>\hat{s}[7] \;</math> являются вторыми вхождениями i в соответствующих строках. Это свойство обычно формулируется так: соответствующие символы имеют ''один и тот же относительный порядок'' в строках F и <math>\hat{s}</math>.




Строка 186: Строка 186:




Рисунок 2. Алгоритмы для вычисления и обращения преобразования Барроуза-Уилера. Процедура sa2bwt вычисляет bwt(s) для исходной строки s и ее суффиксный массив sa. Процедура bwt2psi принимает на вход bwt(s) и вычисляет отображение <math>\Psi \;</math>, сохраняя его в массиве psi. bwt2psi ткже сохраняет в j0 индекс строки, префиксом которой является s[0, n - 1]. bwt2psi использует дополнительный счетчик массива <math>[1, | \Sigma] | \;</math>, который изначально содержит в позиции count[i] количество вхождений в bwt(s) символов 1, ..., i - 1. Наконец, процедура psi2text восстанавливает строки при наличии bwt(s), массива psi и значения <math>j_0 \;</math>.
Рисунок 2. Алгоритмы для вычисления и обращения преобразования Барроуза-Уилера. Процедура sa2bwt вычисляет bwt(s) из исходной строки s и ее суффиксного массива sa. Процедура bwt2psi принимает на вход bwt(s) и вычисляет отображение <math>\Psi \;</math>, сохраняя его в массиве psi. bwt2psi ткже сохраняет в j0 индекс строки, префиксом которой является s[0, n - 1]. bwt2psi использует дополнительный счетчик массива <math>[1, | \Sigma] | \;</math>, который изначально содержит в позиции count[i] количество вхождений в bwt(s) символов 1, ..., i - 1. Наконец, процедура psi2text восстанавливает строки при наличии bwt(s), массива psi и значения <math>j_0 \;</math>.




4430

правок