4446
правок
Локальное выравнивание (с аффинными штрафами за гэп): различия между версиями
Материал из WEGA
Локальное выравнивание (с аффинными штрафами за гэп) (посмотреть исходный код)
Версия от 22:40, 8 мая 2021
, 8 мая 2021→Основные результаты
Irina (обсуждение | вклад) |
Irina (обсуждение | вклад) |
||
| Строка 44: | Строка 44: | ||
Базовый шаг: | Базовый шаг: | ||
<math>H(i, 0) = H(0, j) = 0, 0 \le i \le n, 0 \le j \le m</math> | |||
<math>H_N(i, 0) = H_N(0, j) = - \infty, 0 \le i \le n, 0 \le j \le m</math> | |||
<math>H_S(i, 0) = H_T(0, j) = W_s + W_p, 0 \le i \le n, 0 \le j \le m</math> | |||
<math>H_S(0, j) = H_T(i, 0) = - \infty, 0 \le i \le n, 0 \le j \le m</math> | |||
Шаг рекурсии: | |||
<math>H(i, j) = max \{H_N(i, j), H_S(i, j), H_T(i, j), 0 \}, 1 \le i \le n, 1 \le j \le m</math> | <math>H(i, j) = max \{H_N(i, j), H_S(i, j), H_T(i, j), 0 \}, 1 \le i \le n, 1 \le j \le m</math> | ||
<math> | <math>H_N(i, j) = H(i - 1, j - 1) + \delta(s[i], T[j]), 1 \le i \le n, 1 \le j \le m</math> | ||
<math>H_S(i, j) = max \{ H(i - 1, j) - (W_s + W_p), H_S(i - 1, j) - W_p \}, 1 \le i \le n, 1 \le j \le m</math> | |||
<math>H_T(i, j) = max \{ H(i, j - 1) - (W_s + W_p), H_T(i, j - 1) - W_p \}, 1 \le i \le n, 1 \le j \le m</math> | |||
== Применение == | == Применение == | ||
