Аноним

Вершинное покрытие и деревья поиска: различия между версиями

Материал из WEGA
м
 
(не показано 11 промежуточных версий этого же участника)
Строка 10: Строка 10:




Формальное определение задачи выглядит следующим образом. Пусть G – неориентированный граф. Подмножество C вершин графа G является вершинным покрытием G, если хотя бы одна конечная точка каждого ребра G принадлежит к C. Пример (параметризованной) задачи о вершинном покрытии представляет собой пару (G, k), где G – граф, а k – целочисленный параметр; в задаче требуется определить, имеет ли граф G вершинное покрытие из k вершин. Наша цель заключается в разработке параметризованных алгоритмов с временем выполнения O(f(k)p(n)) для нахождения вершинного покрытия, где p(n) – полином более низкой степени от размера входного графа n, а f(k) – неполиномиальная часть, являющаяся функцией от параметра k и независимая от n. Ожидается, что неполиномиальная функция f(k) будет насколько возможно малой. Такой алгоритм будет эффективным на практике, если параметр k будет малым. Следует отметить, что за исключением редко встречающихся в теории сложности случаев функция f(k) является по меньшей мере экспоненциальной относительно параметра k [8].
Формальное определение задачи выглядит следующим образом. Пусть G – неориентированный граф. Подмножество C вершин графа G является [[вершинное покрытие|вершинным покрытием]] G, если хотя бы одна конечная точка каждого ребра G принадлежит к C. Пример (параметризованной) задачи о вершинном покрытии представляет собой пару (G, k), где G – граф, а k – целочисленный параметр; в задаче требуется определить, имеет ли граф G вершинное покрытие из k вершин. Наша цель заключается в разработке параметризованных алгоритмов с временем выполнения O(f(k)p(n)) для нахождения вершинного покрытия, где p(n) – полином более низкой степени от размера входного графа n, а f(k) – неполиномиальная часть, являющаяся функцией от параметра k и не зависящая от n. Ожидается, что неполиномиальная функция f(k) будет насколько возможно малой. Такой алгоритм будет эффективным на практике, если параметр k будет малым. Следует отметить, что за исключением редко встречающихся в теории сложности случаев функция f(k) является по меньшей мере экспоненциальной относительно параметра k [8].
 


== Основные результаты ==
== Основные результаты ==
Строка 18: Строка 18:


== Кернелизация ==
== Кернелизация ==
Предположим, что (G, k) – экземпляр задачи о вершинном покрытии, где G – граф, а k – параметр. Операция кернелизации применяет к экземпляру (G, k) подпрограмму обработки с полиномиальным временем выполнения, которая строит еще один экземпляр (G’, k’), где G’ – граф меньшего размера (ядро), а <math>k’ \le k \;</math>, такой, что G’ имеет вершинное покрытие из k’ вершин в том и только том случае, если G имеет вершинное покрытие из k вершин. В классической работе Немхаузера и Троттера [9] был получен следующий результат, относящийся к кернелизации.
Предположим, что (G, k) – экземпляр задачи о вершинном покрытии, где G – граф, а k – параметр. Операция [[кернелизация|кернелизации]] применяет к экземпляру (G, k) подпрограмму обработки с полиномиальным временем выполнения, которая строит экземпляр (G', k'), где G' – граф меньшего размера ([[ядро]]), а <math>k’ \le k \;</math>, такой, что G' имеет вершинное покрытие из k' вершин в том и только том случае, если G имеет вершинное покрытие из k вершин. В классической работе Немхаузера и Троттера [9] был получен следующий результат, относящийся к кернелизации.




Теорема 1. Существует алгоритм решения задачи о вершинном покрытии с временем выполнения <math>O(kn + k^3) \;</math>, который для экземпляра (G, k) строит еще один экземпляр задачи (G’, k’), где граф G’ содержит не более 2k’ вершин, а <math>k’ \le k \;</math>, такой, что граф G имеет вершинное покрытие из k вершин в том и только том случае, если граф G’ имеет вершинное покрытие из k’ вершин.
'''Теорема 1. Существует алгоритм решения задачи о вершинном покрытии с временем выполнения <math>O(kn + k^3) \;</math>, который для экземпляра (G, k) строит еще один экземпляр задачи (G', k'), где граф G' содержит не более 2k' вершин, а <math>k' \le k \;</math>, такой, что граф G имеет вершинное покрытие из k вершин в том и только том случае, если граф G' имеет вершинное покрытие из k' вершин.'''




Таким образом, кернелизация обеспечивает эффективную предварительную подготовку для решения задачи о вершинном покрытии, которая позволяет работать с графами меньшего размера (т.е. с графами, размер которых зависит только от k).
Таким образом, кернелизация обеспечивает эффективную предварительную обработку для последующего решения задачи о вершинном покрытии, которая позволяет работать с графами меньшего размера (т.е. с графами, размер которых зависит только от k).
 


== Свертка ==
== Свертка ==
Предположим, что v – вершина степени 2 в графе G, имеющая двух соседей u и w, не являющихся смежными друг с другом. Построим новый граф G’ следующим образом: удалим все вершины v, u и w и введем новую вершину v’, смежную со всеми оставшимися соседями вершин u и w в графе G. В таком случае говорится, что граф G’ был получен из графа G в результате свертки вершины v. Для технологии свертки был получен следующий результат.
Предположим, что v – вершина степени 2 в графе G, имеющая двух соседей u и w, не являющихся смежными друг с другом. Построим новый граф G' следующим образом: удалим все вершины v, u и w и введем новую вершину <math>v_0 \;</math>, смежную со всеми оставшимися соседями вершин u и w в графе G. В таком случае говорится, что граф G' был получен из графа G в результате [[свертка|свертки]] вершины v. Для технологии свертки был получен следующий результат.




Теорема 2. Пусть G’ – граф, полученный из графа G в результате свертки вершины v второй степени, два соседа которой не были смежными друг другу. Тогда граф G имеет вершинное покрытие из k вершин в том и только том случае, если G’ имеет вершинное покрытие из k-1 вершины.
'''Теорема 2. Пусть G' – граф, полученный из графа G в результате свертки вершины v второй степени, два соседа которой не были смежными друг другу. Тогда граф G имеет вершинное покрытие из k вершин в том и только том случае, если G' имеет вершинное покрытие из k-1 вершины.'''




Операция свертки позволяет уменьшить значение параметра k без применения ветвления. Такие операции оказались весьма эффективными для разработки экспоненциальных по времени алгоритмов решения задачи о вершинном покрытии. Недавно было предложено расширение операции свертки, допускающее применение к множеству из нескольких вершин графа [6].
Операция свертки позволяет уменьшить значение параметра k без применения ветвления. Такие операции оказались весьма эффективными для разработки экспоненциальных по времени алгоритмов решения задачи о вершинном покрытии. Недавно было предложено расширение операции свертки, допускающее применение к множеству из нескольких вершин графа [6].
 


== Ветвление и поиск ==
== Ветвление и поиск ==
Самой эффективной техникой является метод ветвления и поиска, широко использовавшийся в алгоритмах решения задачи о вершинном покрытии и многих других NP-полных задач. Этот метод можно описать следующим образом. Пусть (G, k) – экземпляр задачи о вершинном покрытии. Предположим, что каким-либо образом определено семейство <math>\{ C_1, ..., C_b \} \;</math> подмножеств графа G (где для каждого i подмножество <math>C_i \;</math> имеет <math>c_i \;</math> вершин), такое, что если граф G содержит вершинное покрытие из k вершин, то по меньшей мере для одного из подмножеств <math>C_i \;</math> существует вершинное покрытие из k вершин для G, содержащее все вершины из <math>C_i \;</math>. После этого можно построить семейство экземпляров меньшего размера <math>(G_i, k_i) \;</math>, где <math>1 \le i \le b \;</math>; <math>k_i = k - c_i \;</math>, а <math>G_i \;</math> получается из G путем удаления всех вершин, входящих в <math>C_i \;</math>. Отметим, что исходный граф G имеет вершинное покрытие из k вершин в том и только том случае, если один из меньших экземпляров <math>(G_i, k_i) \;</math> графа <math>G_i \;</math> имеет вершинное покрытие из <math>k_i \;</math> вершин. Таким образом, процесс может быть разветвлен на b подпроцессов, каждый из которых на меньшем экземпляре задачи <math>(G_i, k_i) \;</math> рекурсивно выполняет поиск вершинного покрытия из <math>k_i \;</math> вершин для графа <math>G_i \;</math>.
Самой эффективной техникой является метод ветвления и поиска, широко использовавшийся в алгоритмах решения задачи о вершинном покрытии и многих других NP-полных задач. Этот метод можно описать следующим образом. Пусть (G, k) – экземпляр задачи о вершинном покрытии. Предположим, что каким-либо образом определено семейство <math>\{ C_1, ..., C_b \} \;</math> подмножеств графа G (где для каждого значения i подмножество <math>C_i \;</math> имеет <math>c_i \;</math> вершин), такое, что если граф G содержит вершинное покрытие из k вершин, то по меньшей мере для одного из подмножеств <math>C_i \;</math> существует вершинное покрытие из k вершин для G, содержащее все вершины из <math>C_i \;</math>. После этого можно построить семейство экземпляров меньшего размера <math>(G_i, k_i) \;</math>, где <math>1 \le i \le b \;</math>; <math>k_i = k - c_i \;</math>, а <math>G_i \;</math> получается из G путем удаления всех вершин, входящих в <math>C_i \;</math>. Отметим, что исходный граф G имеет вершинное покрытие из k вершин в том и только том случае, если один из меньших экземпляров <math>(G_i, k_i) \;</math> графа <math>G_i \;</math> имеет вершинное покрытие из <math>k_i \;</math> вершин. Таким образом, процесс может быть разветвлен на b подпроцессов, каждый из которых на меньшем экземпляре задачи <math>(G_i, k_i) \;</math> рекурсивно выполняет поиск вершинного покрытия из <math>k_i \;</math> вершин для графа <math>G_i \;</math>.


Пусть T(k) – количество листьев в дереве поиска для вышеописанного процесса ветвления и поиска на экземпляре задачи (G, k). Тогда операция ветвления дает следующее рекуррентное соотношение:
 
Пусть T(k) – количество листьев в дереве поиска для вышеописанного процесса ветвления и поиска на экземпляре задачи (G, k). Тогда вышеописанная операция ветвления дает следующее рекуррентное соотношение:


<math>T(k) = T(k - c_1) + T(k - c_2) + ... + T(k - c_b) \;</math>
<math>T(k) = T(k - c_1) + T(k - c_2) + ... + T(k - c_b) \;</math>
Строка 56: Строка 58:




Теорема 3. Задача о вершинном покрытии может быть решена за время <math>O(kn + 1,2852^k) \;</math>.
'''Теорема 3. Задача о вершинном покрытии может быть решена за время <math>O(kn + 1,2852^k) \;</math>.'''




Строка 66: Строка 68:


На основе параметризованного алгоритма, упомянутого в теореме 3, был разработан более быстрый алгоритм для решения другой важной NP-полной задачи – задачи о нахождении максимального независимого множества на разреженных графах [3].
На основе параметризованного алгоритма, упомянутого в теореме 3, был разработан более быстрый алгоритм для решения другой важной NP-полной задачи – задачи о нахождении максимального независимого множества на разреженных графах [3].


== Открытые вопросы ==
== Открытые вопросы ==
Главный нерешенный вопрос в этом направлении исследований заключается в том, насколько далеко по нему можно зайти. Точнее говоря, насколько маленькой может быть константа c > 1, чтобы алгоритм решения задачи о вершинном покрытии имел время выполнения O(ck nO(1))? Более тщательный анализ комбинаторных структур графов позволяет надеяться на некоторое улучшение текущей наилучшей верхней границы [ ]. Несколько недавно разработанных техник [ ] также обещают улучшить значение верхней границы. С другой стороны, известно, что константа c не может быть произвольно близкой к 1, за исключением определенных, редко встречающихся в теории сложности случаев [8].
Главный нерешенный вопрос в этом направлении исследований заключается в том, насколько далеко по нему можно зайти. Точнее говоря, насколько маленькой может быть константа c > 1, чтобы алгоритм решения задачи о вершинном покрытии имел время выполнения <math>O(c^k n^{O(1)}) \;</math>? Более тщательный анализ комбинаторных структур графов позволяет надеяться на некоторое улучшение текущей наилучшей верхней границы [4]. Некоторые недавно разработанные техники [6] также обещают улучшить значение верхней границы. С другой стороны, известно, что константа c не может быть произвольно близкой к 1, за исключением определенных, редко встречающихся в теории сложности случаев [8].




== Экспериментальные результаты ==
== Экспериментальные результаты ==
Несколько групп исследователей реализовали на практике идеи, лежащие в основе алгоритма теоремы 3 или ее вариаций; в их числе можно упомянуть проекты «Параллельные методы в биоинформатике» Карлтонского университета [2], «Высокопроизводительные вычислительные системы» университета Теннесси [ ] и проект «DARWIN» Швейцарской высшей технической школы Цюриха (ETH Zurich) [10, 11]. Как было отмечено в [ ], эти разработки показали, что данный алгоритм и связанные с ним техники оказались весьма практичными для решения задачи о вершинном покрытии при значении параметра k, меньшем 400.
Несколько групп исследователей реализовали на практике идеи, лежащие в основе алгоритма теоремы 3 или ее вариаций; в их числе можно упомянуть проекты «Параллельные методы в биоинформатике» Карлтонского университета [2], «Высокопроизводительные вычислительные системы» университета Теннесси [1] и проект «DARWIN» Швейцарской высшей технической школы Цюриха (ETH Zurich) [10, 11]. Как было отмечено в [5], эти разработки показали, что данный алгоритм и связанные с ним техники оказались весьма практичными для решения задачи о вершинном покрытии при значении параметра k, меньшем 400.




Строка 78: Строка 81:
* ''[[Редукция данных для доминирования в графах]]
* ''[[Редукция данных для доминирования в графах]]
* ''[[Локальные аппроксимации задач упаковки и покрытия]]
* ''[[Локальные аппроксимации задач упаковки и покрытия]]
* ''[[Алгоритмы локального поиска для kSAT]]
* ''[[Алгоритмы локального поиска для k-КНФ]]
* ''[[Кернелизация вершинного покрытия]]
* ''[[Кернелизация вершинного покрытия]]


4446

правок