Аноним

Супердерево максимального соответствия: различия между версиями

Материал из WEGA
м
Строка 2: Строка 2:
   
   


Пусть T – дерево, листья которого уникальным образом снабжены метками из набора таксонов S. Под уникальным образом мы понимаем то обстоятельство, что в T нет двух листьев с одинаковыми метками. Если дано подмножество S0 множества S, то топологическое ограничение T согласно S0 (обозначается TjS0) представляет собой дерево, полученное в результате удаления из T всех вершин, не лежащих ни на одном пути из корня к листу из подмножества S0, вместе с инцидентными им ребрами, и последующего сжатия каждого ребра между вершиной, имеющей только одного потомка, и самим этим потомком (см. рис. 1). Для любого дерева T обозначим множество меток его листьев как A(T).
Пусть T – дерево, листья которого уникальным образом снабжены метками из набора таксонов S. Под уникальным образом мы понимаем то обстоятельство, что в T нет двух листьев с одинаковыми метками. Если дано подмножество S' множества S, то топологическое ограничение T согласно S' (обозначается T|S') представляет собой дерево, полученное в результате удаления из T всех вершин, не лежащих ни на одном пути из корня к листу из подмножества S', вместе с инцидентными им ребрами, и последующего сжатия каждого ребра между вершиной, имеющей только одного потомка, и самим этим потомком (см. рисунок). Для любого дерева T обозначим множество меток его листьев как <math>\Lambda (T) \;</math>.


[[Файл:Max_agr_supertree.jpg]]  
[[Файл:Max_agr_supertree.jpg]]  


Пусть T – дерево с левой стороны. Тогда Tj fa; c; dg дерево, показанное справа
Пусть T – исходное дерево с левой стороны. Тогда дерево справа T|{a, c, d} это топологическое ограничение дерева T.


    
    
4446

правок